Tiger Team Projects

The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click

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Tiger Team: tt-plants

Development and implementation of bioinformatic workflows incl. data managent for sequence analysis of plants

Mit diesem Tiger-Team sollen die Grundlagen für die Sequenzanalyse von Pflanzengenomen und -transkriptomen auf dem bwGRiD und zukünftig auf dem BINAC geschaffen werden. Zum einen mussten hierfür verschiedenste Programme auf dem Cluster installiert und mithilfe der Anwender getestet werden, zum anderen ist eine Infrastruktur für den Datentransfer von großen Rohdaten über weite Strecken (in Kooperation mit dem Cold Spring Habor Laboratory (New York, USA) geschaffen worden.

Mitglieder des Tiger-Teams: Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen, Universität Tübingen; Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA; Zentrum für Datenverarbeitung, University of Tübingen

Status: abgeschlossen.