Tiger Team Projects

The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click

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Tiger Team: tt-siesta

Performance Improvement of Siesta

Das Programm Siesta wird unter Anderem in der elektronischen Strukturberechnung oder zur Molekulardynamik-Simulation verwendet. In gewissen Situationen kommt es allerdings mit einer Standardinstallation zu Abstürzen. Dies lässt sich beheben, indem Optimierungsoptionen im Compiler deaktiviert werden und OpenMPI anstelle von IntelMPI verwendet wird. Das Ziel dieses Tiger-Teams war die Identifikation und Lösung des Problems und die clusterweite Bereitstellung eines optimierten Siesta Moduls. Als Grund für den Absturz konnte schließlich ein Speicherleck ermittelt werden, das unter gewissen Umständen in der MPI Bibliothek von Intel auftritt. Intel konnte den Bug in einer neueren Version beheben und das optimierte Siesta konnte in manchen Fällen bis zu einem Faktor 4 beschleunigt werden.

Mitglieder des Tiger-Teams: Institute for Computational Physics, Universität Stuttgart; kiz, Universität Ulm

Status: abgeschlossen.