Tiger Team Projects
The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click
HoReX - Hochdurchsatzanalyse zur Retinologischen Expertenanalyse
Ziel des Tiger Teams "Hochdurchsatzanalyse im Rahmen der Nationalen Kohorte" (HoReX) ist die Erstellung eines Konzeptes für die Implementierung der zuvor beschriebenen Analysepipeline auf den HPC-Ressourcen des bwHPC in Baden-Württemberg und dessen Umsetzung. Neben der Entwicklung der lokalen Komponenten gehört hierzu auch der sichere Datenaustausch zwischen den Standorten über ein öffentliches WAN sowie die Optimierung der ARIA Software für den Einsatz auf parallelen HPC-Systemen. Anschließend erfolgt die Entwicklung von geeigneten Tools mit einer grafischen Benutzeroberfläche zur Überwachung und Steuerung der einzelnen Komponenten.
Mitglieder des Tiger-Teams: Forschungsinstitut für Augenheilkunde, Universität Tübingen; Institut für Informatik, Hochschule Reutlingen; Universitäts-Augenklinik, Universität Tübingen; HPC-Kompetenzzentrum für Bioinformatik und Astrophysik, Universität Tübingen; Kommunikations- und Informationszentrum, Universität Ulm
Status: abgeschlossen.