The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click

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Implementierung von QM/MM Methoden und Workflows unter Verwendung von Cuby4

Ziel des Tiger-Teams war, die Nutzung verschiedener QM/MM und semi-empirischer Methoden in einem Workflow unter Verwendung des Cuby4-Frameworks zu ermöglichen. Cuby4 verwendet und vereinigt verschiedene Computational Chemistry Software wie beispielsweise Mopac, Amber oder Turbomole. Lizenzfreie Software wie Mopac wurde als Environment Module auf dem Cluster installiert. Mit forschungstypischen Rechenjobs wurde getestet, wie Cuby4 die vorhandenen Resourcen mittels Parallelisierung und GPU-Unterstützung möglichst effizient nutzen kann.

Mitglieder des Tiger-Teams: Markus Zimmermann und Marc Engelhardt, Lab for Molecular Design & Pharmaceutical Biophysics, Universität Tübingen; Felix Bartusch, HPC-Kompentenzzentrum BinA

Status: abgeschlossen.