Tiger Team Projects

The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click

Apply for Tiger Team Project

Tiger Team: tt-cryo

Daten-intensive Verarbeitung von Cryo-Elektronenmikroskopie-Daten

Mit aktuellen Cryo-Elektronenmikroskopen können sehr hohe Auflösungen und Durchsatzraten erzeugt werden, die zu sehr großen Datenmengen führen (im Bereich von Terabytes pro Tag). Im Rahmen der nachgelagerten Analyse werden aus 2D-Projekten von 3D-Objekten die Struktur der Objekte rekonstruiert. Für die Auswertung muss über Monate auf die Originaldaten zugegriffen werden können. Die umfangreichen Daten werden im Dienst "SDS@hd - Scientific Data Storage" gespeichert. Der Analyse-Schritt ist sehr rechenintensiv und erfordert die Verwendung eines Hochleistungsrechners. Hier kommt der bwForCluster MLS&WISO zum Einsatz, der insbesondere über eine Direktverbindung zu SDS@hd verfügt. Das Tiger-Team untersuchte die Prozesse der Datenerzeugung und der Datenanalyse und stellte eine effiziente Verwendung der zuvor genannten Speicher- und HPC-Dienste sicher. Dies erforderte die Installation von entsprechender Software, sowie die Auswahl einer geeigneten Tool-Chain.

Mitglieder des Tiger-Teams: Cryo-Electron Microscopy, Universität Heidelberg; URZ, Universität Heidelberg

Status: abgeschlossen.