Tiger Team Projects

The following enumeration provides an overview of collaborations between members of the bwHPC-S5 team and scientists, i.e. tiger teams. To apply for support by a tiger team, click

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Tiger Team: tt-qiime

QIIME in HPC-Bereich

Zielsetzung des Tiger-Teams war die Unterstützung einer Arbeitsgruppe der Mikrobiologie an der Universität Ulm bei der Datenauswertung von Pyrosequenzierungen mit Hilfe der Software "QIIME" (Quantitative Insights Into Microbial Ecology). Dieses Programmpaket ermöglicht den Vergleich und die Untersuchung mikrobieller Lebensgemeinschaften in verschiedenen Habitaten. Aufgrund des längerfristig erwarteten Speicherbedarfs für diese Art der Analysen sollten die Voraussetzungen für den Einstieg der Arbeitsgruppe in das HPC-Umfeld geschaffen werden. Zu diesem Zweck wurde OIIME als Softwaremodul auf dem bwUniCluster bereit gestellt und die Arbeitsgruppe an die Nutzung der Software in einer HPC-Umgebung heran geführt.

Mitglieder des Tiger-Teams: Institut für Mikrobiologie und Biotechnologie, Universität Ulm; kiz, Universität Ulm

Status: abgeschlossen.